生物信息学(第二版)

BIOINFOMATICS SECOND EDITION

 

      T. Charlie Hodgman (University of Nottingham, UK)

Andrew French (University of Nottingham, UK)

David R. Westhead (University of Leeds, UK)

         

社:Science

号:Q811.4/H689(2)/2010/Y

藏书地点:武大外教中心

 

精要速览系列丛书自1999年面世至今受到了广大读者的关注,2009年科学出版社隆重推出了11个分册导读的新版图书,2010年计划推出9个分册的中译版。编写风格、取材角度仍继承前版特色,在内容上根据各学科的发展进行修订和扩充。自从精要速览系列的生物信息学书籍第一版出版以后,生物信息学领域已经有了实质性的发展,而且正在变成一门具有自身特点的学科。生物信息学是综合计算机科学、信息技术和数学的理论和方法来研究生物信息的交叉学科,包括生物学数据的研究、存档、显示、处理和模拟,基因遗传和物理图谱的处理,核苷酸和氨基酸序列分析,新基因的发现和蛋白质结构的预测等。本书作为生物信息学的第二版,除了介绍生物信息学领域最新的研究进展,作者为化学、生物学、医学和神经学等研究领域的信息学研究者提供了资料;而且也展示了这些通用的信息学技术如何应用在生命科学的大多数领域中。

本书共有三个部分内容组成。第一部分包括AB两章,主要对生物信息学学科进行了介绍,A章概述了使生物信息学成为一个必须领域的因素,B章主要介绍了该学科从20世纪60年代兴起后到现在应用于所有类型的生物信息的21世纪的简要历史。第二部分从C章到I章,介绍了物理学、数学和计算机科学等信息学的基础部分。这一部分虽然对计算机编程没有太多的介绍,但是本书尽力概述了有效的数据管理和程序设计习惯的基础知识。这一部分介绍了概率的概念和概率分布、条件概率和贝叶斯法则,以及基本的统计学检验,同时也阐述了图论及应用,常微分方程和代数学知识,高级模拟技术,以及形状、变性和生长等数学知识。第三部分包含了生物信息学的应用领域,从J章到R章,分别介绍了分子生物学层面,包括新陈代谢内容的解剖学和生理学层面,以及图像的数据集和自然语言文本的信息来源知识。详细介绍的内容有基因组数据库和数据源、转录物组、蛋白质组、代谢组等的数据库资源和研究的技术手段。另外,本章还介绍了超分子的结构和生化动力学、生理学等内容,同时也介绍了图形增强、特征检测、数据析取等内容。

现代生物信息学涵盖的内容相当广泛,本书的三个作者一致认为某些特定的章节由该领域的专家编写更为合适,因此本书也邀请了生物信息学领域的多个专家进行编写。作者试图通过本书给广大生物学工作人员进行科普。本书内容精炼,以相对独立又相互关联的专题形式介绍了各学科的基础知识。本书的版式设计独特,方便学生快速、便捷地领会学科要点,便于学习和记忆。本书的编写风格统一,提供了“结构化”的学习方法。本书是欧美等众多高校的参考书,同时也是国内百家高校双语教学课程的教材。本书是快速、准确掌握专业知识和专业外语的最佳套书,是对教材概念的全新的注释。

 

本书目录:

第一部分:概述

A:生物学研究方式的转变

B:生物信息学的定义

第二部分:物理学、数学和计算机科学等基础介绍

C:物理学要素

D:数据及数据库

E:数据类型

F:计算

G:概率与统计

H:模型与数学技术

I:人工智能和机器学习

第三部分:生物信息学的应用领域

J:基因组及其序列

K:转录物组学

L:蛋白质与蛋白质组学技术

M:代谢物组学

N:超分子结构

O:生化动力学

P:生理学

Q:图像分析

R:文本分析

 

    (王书珍)